Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms