Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO6Q9NRD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO6Q9NRD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms