Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST12Q9NRB3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms