Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHK2Q9NRA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms