Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms