Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIT2Q9NQR4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIT2Q9NQR4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms