Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYLDQ9NQC7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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