Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL40Q9NQ50 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL40Q9NQ50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms