Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms