Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms