Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCM1Q9NP62 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCM1Q9NP62 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms