Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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