Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD4Q9HCU8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD4Q9HCU8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms