Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms