Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UPF2Q9HAU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF2Q9HAU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms