Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms