Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIF1Q9H611 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIF1Q9H611 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIF1Q9H611 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIF1Q9H611 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms