Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4G0

EPB41L1, Band 4.1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1Q9H4G0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPB41L1Q9H4G0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L1Q9H4G0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms