Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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