Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP4Q9H3Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms