Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG9Q9H0W8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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