Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms