Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PDGFDQ9GZP0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms