Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIPCQ9C0C6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366 ms