Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INO80BQ9C086 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms