Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP1Q9C000 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP1Q9C000 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms