Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN6Q9BZV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN6Q9BZV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms