Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4Q9BZE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4Q9BZE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms