Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDHR2Q9BYE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms