Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REPIN1Q9BWE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REPIN1Q9BWE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms