Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF20Q9BVI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF20Q9BVI0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF20Q9BVI0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF20Q9BVI0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF20Q9BVI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF20Q9BVI0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF20Q9BVI0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms