Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PBDC1Q9BVG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms