Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR18Q9BV38 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR18Q9BV38 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR18Q9BV38 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR18Q9BV38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR18Q9BV38 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms