Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE6

ISCA1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA1Q9BUE6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCA1Q9BUE6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ISCA1Q9BUE6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCA1Q9BUE6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms