Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRACR2AQ9BSW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms