Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERPUD2Q9BSE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD2Q9BSE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms