Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MESP1Q9BRJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms