Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms