Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN3Q9BQT9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms