Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FYCO1Q9BQS8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms