Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HINFPQ9BQA5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINFPQ9BQA5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HINFPQ9BQA5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms