Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMSS1Q9BQ75 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms