Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX2Q9BQ50 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms