Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOPXQ9BPY8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOPXQ9BPY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOPXQ9BPY8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms