Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3AQ99856 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms