Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSG101Q99816 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSG101Q99816 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms