Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms