Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGMAR1Q99720 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIGMAR1Q99720 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms