Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBBP8Q99708 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP8Q99708 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP8Q99708 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms