Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX2Q99697 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms